Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DDR2Q16832 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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