Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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E2F4Q16254 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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E2F4Q16254 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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E2F4Q16254 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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E2F4Q16254 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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E2F4Q16254 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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