Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3AQ14563 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms