Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCOA4Q13772 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms