Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 BTN3A2-202ENST00000377708 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CAMK2BQ13554 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms