Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms