Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMD2Q13200 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms