Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CBX3Q13185 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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