Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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STRN3Q13033 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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STRN3Q13033 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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STRN3Q13033 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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STRN3Q13033 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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STRN3Q13033 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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