Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TROQ12816 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TROQ12816 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TROQ12816 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms