Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXO1Q12778 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms