Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms