Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms