Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FMODQ06828 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FMODQ06828 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FMODQ06828 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FMODQ06828 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FMODQ06828 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FMODQ06828 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FMODQ06828 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FMODQ06828 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FMODQ06828 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FMODQ06828 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FMODQ06828 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms