Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms