Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL356585.3-201ENST00000625196 1017 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP006222.1-201ENST00000442116 1292 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 OR7E109P-201ENST00000445529 855 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CCND2-AS1-201ENST00000539135 555 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC244131.1-201ENST00000542152 922 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC104564.6-201ENST00000582881 1052 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms