Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms