Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms