Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD3P84022 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms