Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms