Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms