Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms