Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms