Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms