Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLH1P40692 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLH1P40692 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLH1P40692 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLH1P40692 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLH1P40692 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLH1P40692 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms