Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NTF4P34130 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF4P34130 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NTF4P34130 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NTF4P34130 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NTF4P34130 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NTF4P34130 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NTF4P34130 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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