Protein–RNA interactions for Protein: P20382

PMCH, Pro-MCH, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHP20382 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHP20382 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHP20382 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms