Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms