Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LIG1P18858 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LIG1P18858 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LIG1P18858 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LIG1P18858 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LIG1P18858 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LIG1P18858 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LIG1P18858 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LIG1P18858 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LIG1P18858 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LIG1P18858 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LIG1P18858 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LIG1P18858 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LIG1P18858 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LIG1P18858 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LIG1P18858 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIG1P18858 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms