Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ITGB6P18564 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGB6P18564 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms