Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYN1P17600 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYN1P17600 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYN1P17600 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYN1P17600 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYN1P17600 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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