Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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