Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB1P16220 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB1P16220 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CREB1P16220 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CREB1P16220 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CREB1P16220 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CREB1P16220 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CREB1P16220 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CREB1P16220 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CREB1P16220 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CREB1P16220 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CREB1P16220 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CREB1P16220 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CREB1P16220 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CREB1P16220 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms