Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms