Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PCNAP12004 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PCNAP12004 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PCNAP12004 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PCNAP12004 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PCNAP12004 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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