Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRFP10586 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRFP10586 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRFP10586 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRFP10586 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRFP10586 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRFP10586 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PTPRFP10586 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PTPRFP10586 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PTPRFP10586 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PTPRFP10586 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PTPRFP10586 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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