Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2P0DI81 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms