Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms