Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms