Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HACD1B0YJ81 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD1B0YJ81 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms