Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms