Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms