Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z0

BACE2, Beta-secretase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE2Q9Y5Z0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE2Q9Y5Z0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE2Q9Y5Z0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE2Q9Y5Z0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE2Q9Y5Z0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE2Q9Y5Z0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE2Q9Y5Z0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BACE2Q9Y5Z0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BACE2Q9Y5Z0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BACE2Q9Y5Z0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms