Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR2E3Q9Y5X4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR2E3Q9Y5X4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms