Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPO11Q9Y5K1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms