Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMM9Q9Y5J7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM9Q9Y5J7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms