Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
WASHC2CQ9Y4E1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.8■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.8■■■■□ 3
WASHC2CQ9Y4E1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms