Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDGFL3Q9Y3E1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms