Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D4Q9Y2X8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms