Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP20Q9Y2K6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP20Q9Y2K6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms